渡邊 圭司 わたなべ けいじ

所属・職名

水環境担当 専門研究員

専門学問（環境）分野

水環境化学、微生物生態学、生元素動態

関心のある研究テーマ、 今後の抱負

水圏や土壌圏における生元素動態と微生物の関係など

学位

博士（農学）（筑波大学）

学位論文題目：微細藻類Chlorellaを中心とした共生メカニズムの解明とその応用

経歴

2005年 筑波大学大学院生命環境科学研究科単位取得退学

2005～2009年 茨城県霞ケ浦環境科学センター 湖沼環境研究室 任期付研究員

2010～2012年 独立行政法人国立環境研究所 地域環境研究センター 土壌環境研究室 特別研究員

2012年～ 水環境担当

所属学会

日本微生物生態学会、日本陸水学会、日本有機地球化学会

センターにおける調査・研究テーマ

自主研究事業

• 埼玉県内河川で高い大腸菌数を示す地点の傾向とその原因究明（令和3~5年度）
• 埼玉県内の親水空間における大腸菌数の現状把握（平成29~31年度）
• 浮遊細菌の構成種から見た埼玉県内河川の水質特性評価（平成26~28年度）

行政令達事業

• 水質監視事業
• 工場・事業場水質規制事業
• 水質事故対策事業

 外部競争的資金による研究

【代表】

• 浮遊細菌を介した未知の窒素動態が淡水圏の窒素循環に与える影響（科研費 基盤(C)／令和4~6年度）
• 河川の浮遊細菌を介した新たなリン循環プロセスとその地球化学的意義の解明（科研費 基盤(C)／平成31~令和3年度）
• 河川から高頻度に検出される浮遊細菌による新規リン循環プロセスの解明（科研費 若手(B)／平成27~29年度）

• 湖沼における浮遊細菌を介した溶存有機物動態解明に向けた新たな展開（科研費 若手(B)／平成23~24年度）

【分担】

• 水圏環境中の抗生物質に対する自然細菌群集の脆弱性とその物質循環に対する影響（科研費 基盤(B)／令和3~5年度）
• 微生物不活性化手法を用いた海成堆積物の長期・短期汚染リスク同時抑制手法の開発（科研費 基盤(C)／令和3~5年度）
• 貝殻が有する黄鉄鉱の風化抑制機能を利用した海成堆積物の低コスト汚染対策手法の開発（科研費 基盤(C)／平成28~30年度）
• 持続的水環境保全に向けた中国山西省における生物による水質調査と環境教育への適用（科研費 基盤(B)／平成27~30年度）

 研究業績

査読付き原著論文

【筆頭】

• Ogata Y, Watanabe K, Takemine S, Kaida K, Tanokura M, Suda W (2023) Complete genome sequences of two Polynucleobacter sp. subcluster PnecA strains, SHI2 and SHI8, isolated from an oligotrophic-dystrophic Lake in Japan. Microbiology Resource Announcements, 12, e00030-23.
• Ogata Y, Watanabe K, Takemine S, Kaida K, Tanokura M, Suda W (2023) Complete genome sequence of Aurantimicrobium sp. strain INA4, isolated from an oligotrophic lake in Japan. Microbiology Resource Announcements, 12, e01247-22.
• Ogata Y, Watanabe K, Takemine S, Shindo C, Kurokawa R, Suda W (2023) Complete genome sequences of three Limnohabitans sp. (Lhab-A3) strains, INBF002, TEGF004, and MORI2, isolated from two lakes and a river in Japan. Microbiology Resource Announcements, 12, e01296-22.
• Ogata Y, Watanabe K, Takemine S, Shindo C, Kurokawa R, Suda W (2023) Complete genome sequences of three Polynucleobacter sp. subcluster PnecC strains, KF022, KF023, and KF032, isolated from a shallow eutrophic lake and a river in Japan. Microbiology Resource Announcements, 12, e01234-22.
• Ogata Y, Watanabe K, Takemine S, Kaida K, Tanokura M, Suda W (2022) Complete genome sequences of Rhodoluna sp. strains KAS3 and KACHI23, isolated from lake and river surface water. Microbiology Resource Announcements, 11, e01122-22.
• Ogata Y, Watanabe K, Takemine S, Shindo C, Kurokawa R, Suda W (2022) Whole genome sequence of Sediminibacterium sp. strain TEGAF015 isolated from a shallow eutrophic freshwater lake in Japan. Microbiology Resource Announcements, 11, e00882-22.
• Ogata Y, Watanabe K, Takemine S, Kaida K, Tanokura M, Suda W (2022) Complete genome sequence of Aquiluna sp. strain KACHI24, isolated from river surface water. Microbiology Resource Announcements, 11, e00858-22.
• Watanabe K, Kitamura T, Ogata Y, Shindo C, Suda W (2022) Flavobacterium ammonificans sp. nov. and Flavobacterium ammoniigenes sp. nov., ammonifying bacteria isolated from surface river water. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 72.
• Watanabe K, Morohoshi S, Kunihiro T, Ishii Y, Takayasu L, Ogata Y, Shindo C, Suda W (2020) Fluviibacter phosphoraccumulans gen. nov., sp. nov., a polyphosphate accumulating bacterium of Fluviibacteraceae fam. nov., isolated from surface river water. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 70, 5551–5560.
• Watanabe K, Ishii Y, Komatsu N, Kitamura T, Watanabe M, Yamamura S, Imai A, Hayashi S (2017) Growth rates and tolerance to low water temperatures of freshwater bacterioplankton strains: ecological insights from shallow hypereutrophic lakes in Japan. Hydrobiologia, 792, 67–81.
• Watanabe K, Kohzu A, Suda W, Yamamura S, Takamatsu T, Takenaka A, Koshikawa MK, Hayashi S, Watanabe M (2016) Microbial nitrification in throughfall of a Japanese cedar associated with archaea from the tree canopy. SpringerPlus, 5, 1596.
• Watanabe K, Komatsu N, Kitamura T, Ishii Y, Park H-D, Miyata R, Noda N, Sekiguchi Y, Satou T, Watanabe M, Yamamura S, Imai A, Hayashi S (2012) Ecological niche separation in the Polynucleobacter subclusters linked to quality of dissolved organic matter: a demonstration using a high sensitivity cultivation-based approach. Environmental Microbiology, 14, 2511–2525.
• Watanabe K, Komatsu N, Ishii Y, Negishi M (2009) Effective isolation of bacterioplankton genus Polynucleobacter from freshwater environments grown on photochemically degraded dissolved organic matter. FEMS Microbiology Ecology, 67, 57–68.
• Watanabe K, Imase M, Aoyagi H, Ohmura N, Saiki H, Tanaka H (2008) Development of a novel artificial medium based on utilization of algal photosynthetic metabolites by symbiotic heterotrophs. Journal of Applied Microbiology, 105, 741–751.
• Watanabe K, Imase M, Sasaki K, Ohmura N, Saiki H, Tanaka H (2006) Composition of the sheath of the green alga Chlorella sorokiniana. Letters in Applied Microbiology, 42, 538–543.
• Watanabe K, Takihana N, Hanada S, Watanabe Y, Ohmura N, Saiki H, Tanaka H (2005) Symbiotic association in Chlorella culture. FEMS Microbiology Ecology, 51, 187–196.

【共著】

• Suda W, Ogata Y, Shindo C, Watanabe K (2022) Complete genome sequences of two Flavobacterium ammonificans strains and a Flavobacterium ammoniigenes strain of ammonifying bacterioplankton isolated from surface river water. Microbiology Resource Announcements e00176-22.
• Morikawa Y, Hayashi S, Negishi Y, Masuda C, Watanabe M, Watanabe K, Masaka K, Matsuo A, Suzuki M, Tada C, Seiwa K (2022) Relationship between the vertical distribution of fine roots and residual soil nitrogen along a gradient of hardwood mixture in a conifer plantation. New Phytologist 235, 993–1004.
• Mishima I, Masuda S, Kakimoto T, Ikeda K, Watanabe K, Maruo C, Nishimura O (2021) Assessment of nitrous oxide production in eutrophicated rivers with inflow of treated wastewater based on investigation and statistical analysis. Environmental Monitoring and Assessment 193, 93.
• Suda W, Ogata Y, Takayasu L, Shindo C, Watanabe K (2021) Complete genome and plasmid sequences of three Fluviibacter phosphoraccumulans polyphosphate-accumulating bacterioplankton strains isolated from surface river water. Microbiology Resource Announcements, 10, e01474-20.
• 木持謙, 渡邊圭司, 田中仁志, 鈴木健太, 田村和大, 高橋唯, 斎藤弥生, 近藤貴志, 水島康一郎, 太田宗宏,小出水規行（2020）環境DNAメタバーコーディングを用いた生活排水流入河川の魚類多様性評価, 用水と排水, 62, 47–58.
• Nishikiori T, Watanabe M, Koshikawa MK, Takamatsu T, Watanabe K, Yamamura S, Hayashi S (2019) ¹³⁷Cs transfer from canopies onto forest floors at Mount Tsukuba in the four years following the Fukushima nuclear accident. Science of the Total Environment, 659, 783–789.
• 北村立実, 渡邊圭司, 吉尾卓宏, 戸田任重, 内海真生, 黒田久雄 (2018) 霞ヶ浦底泥における脱窒速度の水平・垂直分布と窒素除去量の推計, 水環境学会誌, 41, 213–221.
• Nishikiori T, Watanabe M, Koshikawa MK, Takamatsu T, Ishii Y, Ito S, Takenaka A, Watanabe K, Hayashi S (2015) Uptake and translocation of radiocesium in cedar leaves following the Fukushima nuclear accident. Science of the Total Environment, 502, 611–616.
• 北村立実, 渡邊圭司, 須能紀之, 吉尾卓宏, 位田俊臣, 花町優次, 中村剛也, 戸田任重, 林誠二, 黒田久雄 (2014) 霞ヶ浦底泥における脱窒活性の分布特性及び水温と硝酸イオン濃度の影響, 水環境学会誌, 37, 265–271.
• Kosaka T, Toh H, Fujiyama A, Sakaki Y, Watanabe K, Meng X-Y, Hanada S, Toyoda A (2014) Physiological and genetic basis for self-aggregation of a thermophilic hydrogenotrophic methanogen, Methanothermobacter strain CaT2. Environmental Microbiology Report, 6, 268–277.
• Yamamura S, Watanabe K, Suda W, Tsuboi S, Watanabe M (2014) Effect of antibiotics on redox transformations of arsenic and diversity of arsenite-oxidizing bacteria in sediment microbial communities. Environmental Science & Technology, 48, 350–357.
• Kong YH, Watanabe M, Nagano H, Watanabe K, Yashima M, Inubushi K (2013) Effects of land-use type and nitrogen addition on nitrous oxide and carbon dioxide production potentials in Japanese Andosols. Soil Science and Plant Nutrition, 59, 790–799.
• Shimotori K, Watanabe K, Hama T (2012) Fluorescence characteristics of humic-like fluorescent dissolved organic matter produced by various taxa of marine bacteria. Aquatic Microbial Ecology, 65, 249–260.
• 北村立実, 黒田久雄, 石井裕一, 吉尾卓宏, 山本麻美子, 小松伸行, 渡邊圭司, 本間隆満, 田渕俊雄 (2011) 代かき田植え期における用排水機場からの負荷特性. 水環境学会誌, 34, 73–80.
• Imase M, Watanabe K, Kitamura T, Tanaka H, Aoyagi H (2011) Screening for lectin-like protein-producing microorganisms based on cell surface proteins. Canadian Journal of Microbiology, 57, 78–83.
• Narukawa M, Watanabe K, Inoue Y (2011) Light-induced root hair formation in lettuce (Lactuca sativa L. cv. Grand Rapids) roots at low pH is brought by chlorogenic acids synthesis and sugar. Journal of Plant Research, 123, 789–799.
• 小松伸行, 石井裕一, 渡邊圭司, 本間隆満, 北澤大輔 (2010) 霞ヶ浦における貧酸素水塊の観測と解析. 水工学論文集, 54, 1399–1404.
• Ishii Y, Harigae S, Tanimoto S, Yabe T, Yoshida T, Taki K, Komatsu N, Watanabe K, Negishi M, Tatsumoto H (2010) Spatial variation of phosphorus fractions in bottom sediments and the potential contributions to eutrophication in shallow lakes. Limnology, 11, 5–6.
• Ishii Y, Yabe T, Nakamura M, Amano Y, Komatsu N, Watanabe K (2010) Effect of nitrate on phosphorus mobilization from bottom sediment in shallow eutrophic lakes. Journal of Water and Environment Technology, 7, 163–176.
• Iwase A, Hideno A, Watanabe K, Mitsuda N, Ohme-Takagi M (2009) A chimeric NST repressor has the potential to improve glucose productivity from plant cell walls. Journal of Biotechnology, 142, 279–284.
• 小松伸行, 石井裕一, 渡邊圭司, 本間隆満, 北澤大輔 (2009) 非成層期の霞ヶ浦（西浦・北浦）における吹送流の特性. 水工学論文集, 53, 1291–129.
• 石井裕一, 北村立実, 渡邊圭司, 小松伸行, 天野佳正, 矢部徹 (2009) 河川の水質形成と集水域の土地利用形態との関係. 水環境学会誌, 32, 139–146.
• 小松伸行, 石井裕一, 渡邊圭司, 本間隆満, 北村立実, 根岸正美, 岩崎順 (2008) 富栄養化した霞ヶ浦の堆積物に養殖の痕跡を残すリンの形態と分布. 陸水学雑誌, 69, 193–208.
• 石井裕一, 小松伸行, 張替慧, 矢部徹, 渡邊圭司, 根岸正美, 岩崎順 (2008) 霞ヶ浦におけるコイ養殖漁場低泥中の形態別リン分布の特徴. 日本水産学会誌, 74, 607–614.
• 小松伸行, 石井裕一, 本間隆満, 渡邊圭司, 根岸正美 (2008) EOFを用いた北浦湖流に及ぼす風の影響の検討. 陸水学雑誌, 69, 39–49.
• Imase M, Watanabe K, Aoyagi H, Tanaka H (2008) Construction of artificial symbiotic community using Chlorella-symbiont association as a model. FEMS Microbiology Ecology, 63, 273–282.

【その他】

• 渡邊圭司、池田和弘、柿本貴志、見島伊織、梅沢夏実、木持 謙、田中仁志、川合裕子、木村久美子、和波一夫、石井裕一 (2019) 特定酵素基質培地法で大腸菌数に影響を及ぼす因子、全国環境研会誌、44、63–70.
• 渡邊圭司、今瀬将人、大村直也、斉木 博、田中秀夫 (2006) 微細藻類と従属栄養微生物との共生現象とその応用、生物工学会誌、 84、448–451.

書籍

• 木幡邦男、髙橋基之、田中仁志、王効挙、木持謙、見島伊織、池田和弘、柿本貴志、渡邊圭司、袁進、蕎暁荣、李超、斉朔風、恵暁梅、楊凱、李蕎、何泓、張瑤 (2016) 中国山西省晋城市沁河流域の水生生物調査図録 山西省科学技術出版社

 社会的貢献・活動

 

国立研究開発法人国立環境研究所客員研究員（2013年～）

環境省大腸菌の環境基準化に係る検討会委員（2016～2017）