難病指定医療機関・難病指定医に関する申請方法

難病指定医療機関及び難病指定医の申請手続は、原則、オンラインでのみ受け付けています（さいたま市の医療機関を除く）。

令和8年2月1日から新たなシステム（埼玉県事業者オンライン申請サービス）での受付を開始します。

なお、以前使用していた旧システム（事業者申請ポータル）は令和8年1月末で申請受付を終了しますが、1月末までに申請を行った手続きに関する指定書は旧システムから交付されます。

※1　インターネットが繋がらないなど、特段の事情がある場合は、疾病対策課までご連絡ください。(電話番号：048-830-3491)

※2　臨床調査個人票のオンライン化との関連性はございません。

※3　医療機関の所在地がさいたま市内である場合は、申請手続先はさいたま市保健所となります。さいたま市内の医療機関については、以下のさいたま市保健所ホームページを御確認ください。

＜さいたま市保健所ホームページ＞https://www.city.saitama.lg.jp/008/016/001/003/index.html

申請システム（埼玉県事業者オンライン申請サービス）について

令和8年2月1日から以下申請システム（埼玉県事業者オンライン申請サービス）にて申請を受け付けます。下記画像をクリックすると申請システムに移行します。

埼玉県事業者オンライン申請サービスは現時点でも利用可能となっており、ユーザー登録を行うことができます。
ただし、難病指定医療機関・難病指定医に関する申請は2月1日から対応可能になりますので、ご注意ください。

申請システム（埼玉県事業者オンライン申請サービス）に関する概要はチラシ（PDF：871KB）（別ウィンドウで開きます）を御参照ください。

申請を行う際には、以下のマニュアル等を併せて御参照ください。

○埼玉県事業者オンライン申請サービスご利用マニュアル（簡易版）　■難病指定医療機関の申請■～ユーザー登録・ログイン・紐付け編～（PDF：1,682KB）

○埼玉県事業者オンライン申請サービスご利用マニュアル（簡易版）　■難病指定医の申請■～ユーザー登録・ログイン・紐付け編～（PDF：1,700KB）

○埼玉県事業者オンライン申請サービスご利用マニュアル（簡易版）　■難病指定医療機関・難病指定医の申請■～申請編～（PDF：1,609KB）

※詳細版のマニュアルについては、追って掲載します。

 

オンライン申請の流れ

オンライン申請の流れは下記のとおりです。なお、ユーザー登録や各種申請における入力項目の詳細等については上記に掲載しているマニュアルを御参照ください。

(1)ユーザー登録

　↓

(2)御自身で設定したユーザー名とパスワードを用いてログインし、表示されるメニューから手続きを行いたい申請を選択

　↓

(3)表示される様式に沿って申請内容を入力・申請

　↓

(4)県が申請内容を確認して承認。交付される指定書は、当システム上でダウンロードできるようになります。

　※受付完了時及び承認時にはご登録いただいたメールアドレスに通知が届きます。

　※申請～指定書の交付まで概ね一か月程度かかります。

オンライン申請における留意事項

令和8年1月31日時点で指定を受けている難病指定医療機関や難病指定医が、当システムを利用して申請（変更・更新・辞退）を行う場合、下記の点にご留意ください。

• 旧システム（事業者申請ポータル）を利用したことがある場合でも、別システムとなるため、新たにユーザー登録が必要となります。
• 過去に旧システムで申請したデータを連携させるため、ユーザー登録時に「旧システムデータ紐付けキーの入力」 または「既存ユーザーのメールアドレス欄の入力」が必要となります。詳細は令和8年1月末に送付している通知（※）を御確認ください。

　　※難病指定医療機関に関する通知は、法人が埼玉県内に複数の医療機関を有する場合は各法人宛て、それ以外の場合は各医療機関宛てに送付しております。

　難病指定医に関する通知は、各医療機関宛てに送付しております。

• 複数の難病指定医が在籍している医療機関において、旧システムで難病指定医個人がユーザー登録を行って申請管理し、本システムにおいても同様に管理する場合は、旧システムデータ紐付けキーを入力してデータの連携を行う前に必ず下記担当に御連絡ください。
• 法人が埼玉県内（さいたま市を除く）に複数の難病指定医療機関を有する場合 かつ 法人が申請業務を行わない場合においては、原則下記のとおり対応をお願いいたします。なお、下記対応を行った場合、過去申請を引用する際に同法人に属する他の難病指定医療機関（さいたま市を除く）の申請が参照できるようになります。万一、法人において対応が難しい場合は下記担当に御連絡ください。

従来どおりの様式を使用して申請する場合（紙での申請）

難病指定医療機関及び難病指定医の申請手続は、原則、オンラインでのみ受け付けています（さいたま市の医療機関を除く）。

しかし、インターネットが繋がらないなど、特段の事情がある場合は、一時的に紙での申請に対応する場合があります。

その際は、以下の申請様式を確認してください。

 

• 難病指定医療機関に関する申請

　(1)新規申請：指定医療機関指定申請書 -新規-（様式第3号） word版（ワード：30KB）・pdf版（PDF：159KB）

　(2)更新申請：指定医療機関指定申請書 -更新-（様式第3号）word版（ワード：30KB）・pdf版（PDF：160KB）

　(3)変更届出：指定医療機関変更届出書（様式第4号） word版（ワード：24KB）・pdf版（PDF：115KB）

　(4)辞退申出：指定医療機関辞退申出書（様式第5号）word版（ワード：23KB）・pdf版（PDF：187KB）

 

• 難病指定医に関する申請

　(1)新規申請：指定医指定申請書（新規・更新）（様式第9号）word版（ワード：46KB）・pdf版（PDF：95KB）

　(2)更新申請：指定医指定申請書（新規・更新）（様式第9号）word版（ワード：46KB）・pdf版（PDF：92KB）

　(3)変更届出：指定医の申請に係る事項の変更届出書（様式第10号）word版（ワード：36KB）・pdf版（PDF：86KB）

　(4)辞退申出：指定医辞退申出書（様式第11号）word版（ワード：19KB） ・pdf版（PDF：80KB）

 

• 申請書提出先・問い合わせ先

　〒330-9301
　さいたま市浦和区高砂3-15-1
　埼玉県保健医療部疾病対策課 指定難病対策担当
　電話 048-830-3491